成吉思汗军队攻取撒麻耳干的战斗是空前激烈的，连成吉思汗都感到了此次战争空前的惨烈。
但是，撒麻耳干时一定要攻取旳，成吉思汗是下了很大的决心的。这是因为撒麻耳干是中亚的名城，是花剌子模的首都，向全国发号施令的指挥核心，政治影响极大。占领了首都撒麻耳干，就等于挖了花剌子模的心脏，极大地瓦解花剌子模的斗志。
可是攻占撒马尔干太不容易了。双方的战斗还在激烈地进行。战场上弥漫着浓浓的硝烟，双方的箭矢还在往对方的队伍里飞梭，蒙古军还在用云梯往城里攀登，守军还在奋力守住城墙，不让进攻者越雷池一步。战争处于胶着状态。
成吉思汗骑着马，独自奔行在城外的高地上。成吉思汗锐利的眼睛观察着撒麻耳干城。
成吉思汗的眼睛是锐利的，是军事家的眼睛。他一下子就发现了撒麻耳干的弱点。
成吉思汗发现撒麻耳干城三面环山，一面却是平原。看到这个情况，战略家的心理投进一丝阳光。这块平地正好可以当作战场。成吉思汗不由得笑了，他自言自语道：“这下你完了！”他总是那么自信。即使战斗多么激烈，成吉思汗总能找到获胜的巧门。他仿佛就是战争的机器。
成吉思汗回到汗帐时，恰好攻打讹答剌城的察合台和窝阔台刚刚回来。成吉思汗看着他们高兴的样子，高兴地问道：“哦，我们的勇士们回来了？”
两人向父亲行礼：“父汗，我们回来了。”
成吉思汗表情变得严肃：“你们打得很好，连续作战十来天很辛苦，讹答剌战争打出了我军的威风。但是你们就不要休息了，撒麻耳干久攻不下，你们可以助一臂之力。”
“好的，孩儿们尽力。”
“你们记住，撒麻耳干不同于讹答剌城。”
“就是铁打的城，我们也要把他打烂。”
“嗯，好。”
但是，成吉思汗看到察合台的时候，他感到有些有些事很难办。木阿秃干是察合台的大儿子，他的死讯，察合台还不曾知道。成吉思汗没法告诉察合台这一噩耗。天下哪个父亲都受不了这样的噩耗的折磨，更何况木阿秃干那么优秀，察合台又是那么爱自己的孩子。
“你们回去吧，察合台留下，我有话说。”
成吉思汗硬了下心，平静地对察合台说：“我告诉你一件事，可是你不要哭。”
“我不哭，父汗，什么事儿？”
“你的儿子我的好孙子木阿秃干阵亡了。”
“父亲您说什么？”察合台的眼泪一下子流了下来。木阿秃干是他的骄傲，但是这支花儿现在凋谢了。这只英雄之花和天地融在一起了，察合台险些摔倒在地。
“可是父亲，您答应我看好木阿秃干的。”察合台哭着说。过度的悲痛使察合台差点支撑不住。
成吉思汗的脸色严峻起来：“你答应我不哭的。”
察合台带着一腔的悲愤，走出了汗帐。察合台已走出汗帐，就摔倒在地。他太伤心了。
他们走后，耶律楚材走到成吉思汗跟前，
问道：“大汗，他们已经鏖战了十多天，已经相当疲惫了，人马的消耗也很大，再让他们参加战斗，他们恐怕吃不消。”
成吉思汗自信地对耶律楚材说：“蒙古人是不知道疲倦的，他们只会勇往直前。”
正在这个时候，大将者别进来报告：“大汗，据说摩诃末不在撒麻耳干。”
“什么？”听到这个消息的成吉思汗不禁怒目圆睁。摩诃末是花剌子模的象征，让他逃脱就是花剌子模还有缓解的余地。
者别跟随成吉思汗已经多年，他知道成吉思汗在想什么，他解释说：“摩诃末在我们来之前就跑了。”成吉思汗这才心里安定，“哦？这个摩诃末是胆小鬼。”听到者别的话，成吉思汗的脸色当即缓和下来。
“摩诃末必须消灭。者别、速不台、脱忽察儿听令！”成吉思汗庄重地下达战斗命令：
“命你们各代一万精兵，全力追击摩诃末。我要说的是，务必把摩诃末抓住，要不就打死。”
三员大将领受成吉思汗的命令，走出门去。
这时候，耶律楚材走近成吉思汗，好像有话说。这个智慧之神可能又想到了什么，成吉思汗看了看耶律楚材笑着说：“长胡子，有什么话你就说吧。”
耶律楚材这才说：“大汗，撒麻耳干是花剌子模的首都，现在这个城市危在旦夕，其他地方的人是不是会增援呢？”耶律楚材不愧是智多星，他想的就是比别人高一筹。首都是国家的象征，谁也不想当亡国奴。
成吉思汗听了军师的话，眼睛一亮。他一下想起，这很有可能，一个国家在即将亡国的时候，是什么事都做出来的。
成吉思汗和耶律楚材一起走到沙盘跟前，估计从铁门关、塔里寒和钁杀方向有可能有援兵出来。因为从那些地方到达撒麻耳干很便捷。
他们两人几乎同时想到了那里。当他们的手指头在那里汇合的时候，他们都笑了。
成吉思汗当即命令：“着葛答黑率兵一部，进军铁门关，塔里黑地区，截击有可能从那里出来的援兵，不准放他们过来。”这就是说，这是个死命令，不准有闪失。
小将葛答黑受命而去。
“牙撒兀儿听令！”成吉思汗叫来的都是青年将领。耶律楚材知道，大汗是有意让这些尚在成长中的青年将领在战争中得到充分的锻炼。
“着你带领一部兵马，快速到达钁沙地区，截住可能从那里出来的援兵。”
牙撒兀儿受命而去。
耶律楚材这才放心。只要截住他们的援兵，攻打撒麻耳干才可以全力以赴。
可是耶律楚材回头却看见成吉思汗还在凝神思考。这倒奇了，大汗还担心什么呢？
耶律楚材向成吉思汗投去疑问的目光。他们已经配合的很默契，从一个眼神就知道对方心里的秘密。
“我明白你的意思了，你在担心者别他们。我说的对吧？”耶律楚材点点头。摩诃末是这么大花剌子模的国王，他即将要灭亡了，会不会孤注一掷铤而走险呢？
“托雷听令！”成吉思汗喊道。
托
雷是成吉思汗的幼子，很能干，成吉思汗果断地下令：“你带一支军队，进入呼罗珊地区（今伊朗、土库曼斯坦和阿富汗交界处），支援者别他们。”
耶律楚材看着成吉思汗笑了。成吉思汗真乃神人也，把别人的心思看个剔透。成吉思汗这人仗打得好，也能揣摩人的心理。他暗自断言，今后能成就大事业的，只有成吉思汗。
这时候，摩诃末正在率部奔逃。他已经吓得灵魂出窍，几步一回头。他完全失去了先前降服古尔王朝，击败西辽，在中亚穆斯林中的声望如日中天的时候了。
摩诃末由几个人保护着，还在不停地往后看。他已经被蒙古军队打得吓破了胆。他忘了过去被世人称作“亚历山大第二”，这可是个很大的名头，跟“亚历山大”平起平坐的人不是寻常之辈。
摩诃末现在得了“恐慌症”，现在最忌讳听到“蒙古兵”这三个字。他不知道，他这完全是自己找的。这是因为摩诃末完全不了解那些在东方崛起的蒙古人，以至于一开始他还以狂傲自大的态度处理与蒙古人的事情。终于导致战火的燃身。
摩诃末的这个奇怪的病症是这样得的：在这场战争的初始阶段，摩诃末亲自与蒙古军交锋，险些被俘获，这时他被蒙古军的军威所震慑。
这时候的摩诃末已经吓破胆了，开始有了病症的预兆：他的心里早就被慌乱和忧愁所支配，他的言语和行动中常常流露害怕的迹象，由于他满心疑虑，已不能正常的思维和判断，甚至不能正常安眠和宁静了。
摩诃末这样糟糕的心理状态，影响了他的行动计划，他早就做好了逃跑的准备。他把40万大军的大部分摆在河中地区，让他们分兵据守。之所以这样布置军队，是因为他没有取胜的把握，还是选择逃跑。因为，在他的内心世界里，蒙古军队太强大了，没有一支军队能打败他们。
摩诃末布置完军队防守的同时，还让王族家属逃到深山密林中，摩诃末自己随时准备退向阿姆河以南，远走哥疾宁再逃往忻都。这时候的摩诃末被吓破了胆，不顾什么国家了，只有一味地逃跑。甚至在逃跑中，摩诃末还散布消极的语言，完全没有一个国王的样子了。
实际上，摩诃末选择逃跑也有别的原因。这个原因来自摩诃末的家族。花剌子模统治集团内部矛盾重重。在国家领导层中，除了摩诃末的国王权力，还有摩诃末的母亲在跟他的王权相争夺。这使得摩诃末心灰意冷，失去了以前的雄心壮志。
摩诃末的母亲叫秃儿罕可敦，他擅权乱政，与她的儿子摩诃末争权夺利，极大地削弱了国王的权势。秃儿罕可敦下旨，她的旨意与国王的旨意并行颁布全国。
不但如此，秃儿罕可敦擅自将军权授予自己的亲属，使得花剌子模的军队大部为秃儿罕可敦的亲属所控制，这些军队首领甚至图谋除掉摩诃末。这使摩诃末极度伤心。心里没有了国家和人民。
由于摩诃末家族中的矛盾重重，积怨很深，在混乱、危机和明争暗斗中，摩诃末除了逃跑也别无他路。